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Entrevista: la apelación del millón de dólares de Ian Lipkin para un estudio en el Microbioma

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Simon McGrath se aseguró recientemente una entrevista con el mundialmente famoso doctor Ian Lipkin - un científico que sigue creyendo que EM / SFC tiene una causa física - para descubrir más sobre sus planes para un importante estudio del microbioma intestinal y para averiguar por qué está pidiendo el apoyo de la comunidad de pacientes...

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Dr. W. Ian Lipkin ha demostrado un claro compromiso con la investigación en EM / SFC. Primero fue su estudio sobre el virus Borna en la década de 1990, y luego el estudio histórico que descartó el XMRV como causa, y más recientemente hemos oído hablar del enorme estudio en lo inmune y patógenos - una gran colaboración con muchos médicos e investigadores principales, entre ellos el Dr. Dan Peterson y el profesor José Montoya.

Esa investigación ya había encontrado claras señales de activación inmune en pacientes y, cuando hablé con él, Lipkin estaba claramente emocionado por los últimos resultados que iban a surgir del estudio - me gustaría poder revelar más, pero se acaba de presentar el trabajo y los detalles están embargados hasta su publicación.

Lipkin cree que la activación inmune puede ser responsable de la conducción de los síntomas asociados con la EM / SFC. Y que la activación inmune en sí podría ser provocada por microbios, y no en la sangre, pero que se encuentran en el gran ecosistema de bacterias, virus y hongos, que constituyen el microbioma intestinal.

Él, sin embargo, no tiene los fondos para seguir con esta investigación y por eso está apelando a la comunidad de pacientes para conseguir el millón de dólares que necesita para hacer el trabajo. ¿La recompensa? Una mejor comprensión de la enfermedad y la posibilidad de nuevos tratamientos.

Please note: This article was originally published February, 10, 2014, in English, and can be read here.


Dr. Lipkin sobre EM/SFC


Lipkin causó sensación en el mundo de la EM / SFC cuando lideró el estudio XMRV que a la vez ha conseguido demostrar que no jugaba ningún papel en la enfermedad y ha logrado unir la comunidad de pacientes. En la conferencia de prensa para ese estudio, el Dr. Lipkin dijo que su primer encuentro con el SFC fue un estudio a gran escala en la década de 1990 que demostró que no había conexión entre el virus Borna (uno de los muchos virus que él ha descubierto) y el SFC. Sin embargo, subrayó que su hallazgo en el mismo estudio, de la activación de las células B en pacientes con SFC era una clara señal de que no se trataba de un trastorno psicosomático. Los hallazgos de su nuevo estudio sólo han confirmado su punto de vista:

"Yo no dudo en absoluto de que se trata de un trastorno físico. El hecho de que no hemos sido bastante inteligentes o que no hemos invertido suficiente en él para resolverlo, no quiere decir que sea otra cosa."

La pistola humeante


La activación inmune que ha encontrado podría explicar la fatiga - es un síntoma casi universal de infecciones como la gripe, y en realidad es una consecuencia de la activación inmune y no es causado por los propios patógenos.

Lo mismo podría decirse de otros síntomas de EM / SFC, incluyendo los trastornos del sueño y la disfunción cerebral, que a su vez son los síntomas típicos de la activación inmune.

Lipkin está entusiasmado de construir sobre este trabajo. Él cree que la activación inmune es una pistola humeante y ahora quiere localizar al culpable de apretar el gatillo.

"Estoy más interesado que nunca... para ver si podemos identificar al detonador"

- todas las citaciones son del Dr Lipkin

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Hay varios lugares creíbles para buscar a los culpables que desencadenan la activación. Uno de ellos son los globulos blancos de la sangre: algunos virus podrían estar escondidos en las células y por lo tanto no fueron encontrados por la búsqueda inicial en el plasma de la sangre - y Lipkin ya tiene en mente un estudio de glóbulos blancos.

Su atención, no obstante, se concentra particularmente en el microbioma, el gran ecosistema de bichos que viven en nuestra piel y en nuestra "cámara de aire" que va desde la boca hasta el ano.

Hay por lo menos un billón de bichos en el microbioma intestinal - y hay más células inmunes en el intestino que en cualquier otro sitio: es un buen lugar para cazar microbios que podrían estar provocando la activación inmune.

Los problemas con el microbioma son cada vez más vinculados con enfermedades graves. El ejemplo más llamativo es la superbacteria Clostridium difficile (C. diff), que se ha convertido en un problema importante en los hospitales. La C. diff suele vivir en nuestros intestinos sin causar daño cuando está presente en pequeñas cantidades, pero puede asumir el control (sobre todo si se matan las bacterias "buenas") - causando diarrea e incluso la muerte. Menos mal que los médicos han descubierto que los casos graves de C. diff se pueden tratar con relativa facilidad restaurando el microbioma; esto, por desgracia, implica un trasplante fecal.

La posibilidad de tratar esta enfermedad mediante la restauración del microbioma es una de las razones por las cuales esta área de investigación está atrayendo tanta atención. Este artículo reciente explica más sobre el microbioma, cómo se podría vincular a la EM / SFC y habla de otras investigaciones que se están haciendo.

“Si las respuestas fueran simples, ya se habrían dadas”

El Síndrome del Intestino Irritable es otro ejemplo - aquí se cree que la inflamación es el resultado de cambios en el microbioma. El equipo de Lipkin acaba de estudiar mujeres en el África subsahariana y encontró que ciertas bacterias en el microbioma vaginal aumentan el riesgo de infección por VIH. Lipkin piensa que el microbioma intestinal podría jugar un papel igualmente importante en EM / SFC:

“Mediante analogía con situaciones en animales y humanos, vemos que diferentes poblaciones de hongos, bacterias y virus en el colon pueden tener un impacto en el sistema iNmunológico y causar una activación de citoquinas que podría causar los complejos de síntomas que vemos en EM/SFC.”

En otras palabras:

cambios en el microbioma > activación inmune > síntomas de EM/SFC

Pregunté a Lipkin si esto significaba que ciertos microbios en particular causaban inflamación y me respondió que esto ciertamente es posible. Agregó, sin embargo, que otra ruta hacia la enfermedad es que un crecimiento excesivo de bacterias “malas''' podría formar una biopelícula, evitando que las ''buenas'' bacterias interactúen de manera positiva con el sistema inmunológico (ver este artículo para más) – una manera indirecta de causar disfunción inmune.

El papel exacto que juegan los microorganismos en el intestino respecto a la salud y el desarrollo de enfermedades es complejo, y aún está por determinar. Hay muchas hipótesis posibles , dice Lipkin, y sólo la investigación puede demostrar cuales son correctas (si las hay).

Si el microbioma es la causa, ¿es tratable?


Si el microbioma es la causa (o una de ellas o incluso un factor contribuyente) de EM/SFC, podría ser relativamente fácil de tratar, quizás con probióticos, dietas de restricción, medicamentos o incluso trasplantes fecales.

¿Causa o efecto?


Evidentemente, el primer paso en este proceso es demostrar que hay un fuerte vínculo entre el microbioma y EM/SFC. En caso de encontrarlo, el siguiente paso es buscar evidencia de que juega un papel causal: i.e. ¿Son los cambios en el microbioma los que causan la disfunción inmune, lo contrario de ser una consecuencia de o están simplemente asociados con la disfunción inmune?

Lipkin dice que una opción es utilizar un modelo animal: la idea sería introducir los microbios sospechosos de desencadenar EM/SFC en el microbioma intestinal de animales, para ver si esto lleva a síntomas similares y una activación inmune, tal como se ve en humanos. Es algo que ha sido utilizado para estudiar el Síndrome Metabólico.

Medicina personalizada


En caso de haber evidencia de un papel causal, Lipkin dice que buscaría hacer estudios clínicos de tratamientos que incluirían probióticos, antibióticos seguidos de prebióticos, dietas de restricción y posiblemente incluso trasplantes fecales. El cree que no habría un solo microbioma causa de la enfermedad, pero diferentes tipos – posiblemente problemas fúngicos, bacterianos y virales que causan tres tipos separados de disfunción inmune.

Lipkin llama a estos diferentes tipos ‘endofenotipos’ y esto podría llevar a medicina personalizada, donde el tratamiento particular depende de la forma específica de la enfermedad. Habrá endofenotipos más allá de los del intestino, como endofenotipos genéticos, y es muy improbable que el microbioma fuera culpable de todas las formas de EM/SFC – pero este enfoque podría hacer frente a una parte muy sustancial de los casos.

Desglose del estudio


El estudio propuesto por Lipkin estudiará los tres árboles de la vida: bacterias, hongos y virus en el microbioma de 100 pacientes y de 100 controles reclutados para un estudio previo del NIH. Costará la friolera de un millón de dólares :

1. Recolección de muestras: $150,000


Recolección de muestras fecales (y de sangre) de pacientes, y comprobar si el diagnóstico inicial de EM/SFC sigue siendo válido y enviar las muestras refrigeradas de vuelta a los laboratorios en Columbia.

2. Secuenciar y analizar el microbioma fecal: $317,000


- Separar, purificar y realizar secuenciación de alto rendimiento de virus, hongos y bacterias
- Hacer una completa secuenciación de virus; secuenciación parcial para identificar bacterias (con 16S rRNA) y hongos (con ITS, el “código de barras” de los hongos)
- Generar el perfil de microbioma de cada paciente, de cada uno de los 3: bacterias, hongos y virus.​

Comparar los microbioma de pacientes y controles: bacterias, hongos y virus que tienen diferente prevalencia entre los sujetos con SFC y los controles serán considerados candidatos para contribuir a salud o a enfermedad.

3. Desarrollar de ensayos PCR en tiempo real de alta precisión para confirmar hallazgos y niveles de microbios: $328,000


Esto cuantificará la cantidad de cada microbio que hay de interés (el enfoque principal de secuenciación de alto rendimiento proporciona una indicación de la cantidad, pero es menos precisa que la PCR en tiempo real.

Es posible que lo más importante no sea la presencia o ausencia de un microbio, pero la cantidad del mismo - al igual que con el C. difficile. Estos ensayos también se utilizarán para comprobar que no se ha pasado por alto ningún microbio clave en ningún paciente o control que dieron negativos para ellos en la secuencia inicial, precisamente porque ensayos PCR son más sensibles que la secuenciación de alto rendimiento.

4. Análisis de citoquinas: $86,000


El estudio medirá otra vez las citoquinas en sangre y llevará a cabo análisis de datos para ver si existe alguna asociación entre los perfiles de citoquinas y los perfiles inmunes. En ese caso proporcionaría una fuerte evidencia de una relación importante entre el microbioma y la disfunción inmune - la hipótesis que conduce este estudio. Se requerirá el análisis sofisticado de la gran cantidad de datos generados por los perfiles del microbioma y de citoquinas; afortunadamente, el Centro de Infecciones e Inmunidad de Lipkin dispone de un equipo de bioestadistas dedicado a este tipo de trabajo.

5. Desarrollo de pruebas de anticuerpos para microbios importantes identificados por el trabajo en el microbioma: $249,000


Podría ser unas pocas especies individuales o grupos particulares de microbios, pero el laboratorio de Lipkin desarrollará pruebas de anticuerpos para permitir pruebas muchas más fáciles si se encuentran los mismos problemas en esta muestra, que en la población de pacientes más amplia. Además de tratamientos protocolarios, los ensayos PCR y las pruebas de anticuerpos desarrollados aquí pueden servir ambos como prueba de diagnóstico para EM / SFC.


El historial de Lipkin


Apareció en el New York Times, fue descrito por la revista Discovery como el mejor cazador de virus del mundo, y es consultor de una película de éxito de Hollywood. El doctor W. Ian Lipkin tiene un perfil más alto que la mayoría de los investigadores. Pero este perfil se basa en su estelar reputación científica .

Ha descubierto más virus que nadie en el mundo. Forma parte del programa de descubrimiento de diagnósticos y de vigilancia diseñado por la Organización Mundial de la Salud (OMS) para atrapar pandemias en cuanto surjan. China lo reclutó para jugar un papel prominente en su lucha contra SARS.

Entre otras cosas, es Profesor de Epidemiología en John Snow y Director del Centro para Infecciones e Inmunidad de la Universidad de Columbia. Biografía completa.


Le apasiona comunicar la ciencia a un público más amplio, pero insiste en que la ciencia sea correcta.

Lipkin sólo accedió a consultar sobre Contagion, una película sobre el potencial aterrador de las epidemias, porque el director Steven Soderbergh quiso hacer una película que fuera fiel a la ciencia. Había rechazado anteriormente ofertas para asesorar en varias películas con tramas un poco más salvajes.

Cuando Lipkin vio la versión casi final de la película levantó las manos al cielo con una escena cerca del clímax, donde una científica se inyecta en su propia pierna con la nueva vacuna, a través de sus medias - una mala práctica que podría fácilmente causar una infección.

Esto puede parecer un pequeño detalle, dado que todo lo el resto de la película estaba bien, pero Lipkin se mantuvo firme en la rectificación: causó un cambio de la escena de $ 100,000.

Esta casi obsesión por hacer las cosas bien es un sello de Lipkin. La primera observación que me hizo al respecto de este estudio, antes de discutir cualquier detalle, fue la necesidad de conclusiones sólidas y reales - porque ha habido demasiados falsos amaneceres en este campo.

Al final de la entrevista hizo hincapié en la necesidad de datos rigurosos y nítidos. Cualesquiera que sean los resultados de este nuevo estudio - positivos o incluso negativos, tenemos que ser capaces de confiar en ellos.

Un científico ávido de respuestas


El Dr. Lipkin es un científico ávido de respuestas. Esto es verdadero, tanto como respecto a su trabajo cuando intenta parar una nueva pandemia que asoma, como a respecto a su labor en EM/SFC.

Él quiere seguir la mayor cantidad de pistas prometedoras como sea posible, tan pronto como sea posible - en lugar de esperar los resultados de un solo estudio antes de planear otro nuevo en caso de que el primero no tenga éxito.

Por eso ha creado un enorme estudio en busca de patógenos específicos, como el EBV, pero también utiliza la secuenciación profunda para buscar cualquier otro patógeno, conocido o desconocido.

Ha buscado patógenos en el plasma sanguíneo, pero también está a punto de buscarlos en los glóbulos blancos de la sangre.

Además de todo esto , Lipkin ha invertido en un estudio de expresión génica con muestras del mismo estudio, y pronto se esperan los resultados que podrían aclarar más a nivel epigenética y genómica.

Montó el estudio para observar los marcadores inmunes, incluyendo citoquinas, así como los patógenos - y los resultados significativos de la activación inmune muestran la importancia de apostar a más de un caballo.

Además de todo esto, Lipkin ha invertido en un estudio de la expresión génica utilizando muestras del mismo estudio, cuyos resultados se esperan en breve que podría arrojar nuevas pistas en la epigenética y la genómica.

Dr. Lipkin ha investido una enorme cantidad de tiempo de su institución con 60 empleados en numerosos estudios, todo con el propósito de descubrir lo que realmente está pasando en EM / SFC

¿Demasiado y demasiado pronto?

Desafortunadamente puede ser que el NIH no tenga tanta prisa, porque hasta ahora ha rechazado financiar el estudio.

Hasta ahora, el NIH solamente ha asignado cantidades relativamente pequeñas a EM/SFC – más o menos $5 millones al año, comparado con alrededor 115 millones de dólares anuales para la Esclerosis Múltiple y 284 millones de dólares para el Asma.

Su historial de financiación firmemente sugiere que las prioridades del NIH están en otra parte.

Así que - como dice Lipkin - "estamos estancados". Es posible que el NIH financie este trabajo en el futuro, y es posible que no lo haga.

La pregunta es, ¿queremos esperar?

“Ya tenemos mucho retraso”

El Dr. Lipkin ha apelado ahora a pacientes para patrocinar su último estudio que pretende cazar en el microbioma intestinal al ‘desencadenante’ de la activación inmune que su estudio encontró en EM/SFC. Y precisa nada menos que un millón de dólares para pagar el estudio detallado arriba.

En realidad, el estudio sube del millón de dólares (ver arriba) - $1.13 millones, a los que hay que añadir otros 140.000 (did you mean 140,000? We use comma here not .IN ENGLISH COMMA IS USED, IN OTHER LANGUAGES A POINT) dólares al costo para mantener el equipamiento de alta tecnología empleado y los gastos generales de laboratorio, sumando todo 1.27 millones de dólares. Pero, la meta inicial se ha puesto en 1 millón de dólares.

En su CDC telecast a los pacientes en Septiembre, Lipkin explicó que su proyecto de microbioma estaba siendo frenado por esta falta de fondos, e instó a los pacientes a contactar con sus representantes en el Congreso.

También apeló directamente a los pacientes que se lo podían permitir a invertir en la investigación:

“puede que no sea apropiado de pasar el sombrero, pero es exactamente lo que estoy haciendo”

¿Cuánto tiempo hasta obtener los resultados? “En un año”, dijo Lipkin


El hombre tiene prisa, y el estudio está montado y listo para empezar – una vez los fondos estén disponibles.

"Mientras pueda hacerlo, lo haré. Estoy ansioso por empezar, soy optimista en cuanto a dará sus frutos, no es simplemente un ejercicio académico, podría conducir a un tratamiento "”

Cuando mencioné a la Dra. Mady Hornig, la principal investigadora de este estudio, que estaba entrevistando al Dr Lipkin, añadió: “Es terrible – necesitamos estos recursos para poder hacer el estudio”.

Crowdsourcing: Juntos podemos hacer que se realice


Creo que tenemos mucha suerte de tener al Dr Lipkin en nuestro caso y opino que deberíamos apoyar este nuevo estudio, que se hará en este Centro para Infecciones eInmunidad, Universidad de Columbia – el más grande y más avanzado centro académico del mundo en descubrimiento, identificación y diagnóstico de microbios.

“¿Por qué no hacemos esto con crowdsource, todos estamos perdiendo un tiempo valioso de nuestra vida?”

Vanessa Li, miembro y recaudadora de fondos de Phoenix Rising

Vanessa Li, paciente de EM/SFC respondió el año pasado a la llamada de Lipkin, contactando con su oficina y sugiriendo hacer crowdsourcing de manera similar al que hizo MEandYou, que gracias a los esfuerzos de la Dra Maria Gjerpe juntó, en 90 días, la asombrosa cantidad de 0.5 millones de dólares mediante el estudio noruego de Rituximab.

Lipkin era medico general (if you mean GP) en San Francisco cuando comenzó la epidemia del SIDA y comentó que, cuando el gobierno estaba reacio a pagar, gran parte del trabajo temprano importante fue patrocinado por donantes privados, por eso está muy abierto a esta posibilidad. Sigue buscando fondos para su trabajo en instituciones, pero como esto no ha funcionado, ahora está pidiendo a los pacientes si pueden ayudar a que se haga el estudio - y ha dado esta entrevista para lanzar la llamada del millón de dólares.

Dona al estudio del microbioma de EM/SFC


Yo acabo de donar y espero que otros muchos pacientes hagan lo mismo. Simplemente haz clic en el botón abajo y sigue las instrucciones. La opción es donar a la investigación en SFC, pero en la siguiente página puedes añadir ‘instrucciones especiales’ como el ‘estudio del microbioma’.

Solamente necesitamos que cada uno de los pacientes de los EEUU done 1 dólar. O uno de cada diez que done 10 dólares.



Si hay gente que quiere ayudar más – y hay mucho que hacer – pueden ayudar a promover esta iniciativa de crowdsourcing en este grupo nuevo (new group), o email Vanessa Li. Le daré la última palabra:

Los CDC dicen que solamente en los EEUU hay hoy en día más de un millón de pacientes EM/SFC. No hay ningún motivo porque, si cada uno de los pacientes fuese concienciado de la llamada del Dr. Lipkin y donara 1 dólar, no reuniríamos el millón de dólares. Un investigador de renombre que hace trabajo de alta calidad está tomando un gran interés en la búsqueda de la causa de nuestra enfermedad que es desesperadamente poco investigada. ¡Ahora es el momento de actuar!​



Phoenix Rising es una ONG registrada 501 c. (3) sin ánimo de lucro. Apoyamos los pacientes con EM / SFC y Neid a través de informes rigurosos, fiables, defensa eficaz y la prestación de servicios online que permite hacer más fuertes a los pacientes y ayudarles a hacer frente a su aislamiento.

Hay muchas maneras de ayudar a Phoenix Rising a continuar con su labor. Si usted se siente capaz de ofrecer su tiempo y talento, realmente podríamos utilizar más autores, correctores, recaudadores de fondos, técnicos, etc y nos encantaría ampliar nuestro Consejo de Administración. Por lo tanto, si usted cree que puede ayudar, por favor contacte a Mark a través del Foro.

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In a first for Phoenix Rising we are pleased to present the Lipkin Microbiome Appeal and Interview in Spanish. The original article, in English, can be read here:

http://phoenixrising.me/archives/21929

Many thanks to Cathy (in Spain) and Lousi (in America) for their help in translating the article. We hope the appeal will now reach a wider audience and hopefully we can do more translations of articles in the future.